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反相和離子交換模式來分離樣品。這款色譜柱對于分離蛋白質和核酸這樣的酸性成分和堿性成分同時存在的
樣品非常有效。原則上樣品是根據酸性、中性、堿性的順序洗脫。然而，調整流動相的組成也可以調整分離結果。
1) 使用中性/酸性流動相的場合
| 酸性樣品 | 由于離子排阻模式的作用，物質被很快洗脫。 |
|---|---|
| 中性樣品 | 物質由反相模式分離。 |
| 堿性樣品 | 由于離子交換模式的作用，物質的洗脫很慢。 |
2) 使用堿性流動相的場合
| 酸性樣品 | 樣品基本上在Vo的位置一起洗脫，不過酸性樣品分子量特別大的時候，也不排除被色譜柱保留的可能性。 |
|---|---|
| 中性樣品 | 物質由反相模式分離。 |
| 堿性樣品 | 如果流動相的pH值高于樣品的pKa值，由于堿性樣品的解離被抑制，樣品通過反相模式分離。反之則通過離子交換模式分離。 |
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